В статье рассматриваются особенности формирования национальной инновационной системы в контексте структурной трансформации, понятия, структура и основные элементы системы. Рассмотрены факторы и условия, тормозящие переход к инновационной системе, а также факторы, стимулирующие формирование предпринимательского инновационного сектора.